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基因毒性雜質(zhì)是指可能對(duì)生物體細(xì)胞的遺傳物質(zhì)(DNA或RNA)造成損害的化合物或物質(zhì)。這些雜質(zhì)可能導(dǎo)致基因突變、染色體畸變、DNA斷裂等不良影響,進(jìn)而影響細(xì)胞的正常功能和生長(zhǎng),甚至引發(fā)癌癥等疾病。近年對(duì)基因毒性雜質(zhì)的重視持續(xù)提升,引發(fā)了更多關(guān)于基因毒性雜質(zhì)的研究和探討。在新藥研發(fā)的過(guò)程中,基因毒性雜質(zhì)是我們不得不面對(duì)一個(gè)重要的問題。對(duì)其進(jìn)行充分的研究和評(píng)估至關(guān)重要,可以保障患者安全,提高藥物品質(zhì),符合監(jiān)管要求,是新藥研發(fā)中的關(guān)鍵步驟之一。
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01 可以用mini-Ames 試驗(yàn)代替Ames試驗(yàn)嗎?
畢增:按照我們的經(jīng)驗(yàn),在IND申報(bào)階段,雜質(zhì)使用mini-Ames試驗(yàn)可作為正式Ames試驗(yàn)的替代材料進(jìn)行申報(bào)。然而,在新藥上市申報(bào)和仿制藥上市申報(bào)時(shí)應(yīng)該采用標(biāo)準(zhǔn)Ames試驗(yàn),要注意M7(R2)的注釋2所說(shuō)的微量化測(cè)試并不是指mini-Ames試驗(yàn),是指待測(cè)化合物數(shù)量有限不能使用符合指導(dǎo)原則的試驗(yàn)濃度時(shí)可以采取的措施。
02 仿制藥研發(fā),每個(gè)雜質(zhì)都需要進(jìn)行軟件評(píng)估嗎?
畢增:是的,M7(R2)問答中明確建議對(duì)所有雜質(zhì)進(jìn)行模擬和評(píng)估。通過(guò)我直播中分享的案例,可以看到一些化合物,即使沒有基因毒性警示結(jié)構(gòu),也可能具有基因毒性。因此,即使某些化合物不在我們的警示結(jié)構(gòu)列表中,仍需對(duì)其進(jìn)行評(píng)估,因?yàn)樗鋵?shí)也是可能有基因毒性的。
03 如果有Ames試驗(yàn)數(shù)據(jù),還需要進(jìn)行軟件評(píng)估嗎?
畢增:需要根據(jù)情況而定。如果數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的Ames試驗(yàn)是不是符合OECD指導(dǎo)原則或ICH S2的標(biāo)準(zhǔn)Ames試驗(yàn),即是否使用了5種菌株,并且在有代謝激活和沒有代謝激活兩種途徑下都進(jìn)行了實(shí)驗(yàn),并且試驗(yàn)應(yīng)該是符合GLP規(guī)范的,在滿足以上前提的情況下,Ames試驗(yàn)Negative,那么就無(wú)需進(jìn)行軟件評(píng)估,但是需要進(jìn)行比較全面的數(shù)據(jù)庫(kù)檢索。
04 是在藥品研發(fā)的哪個(gè)階段評(píng)估呢?
畢增:根據(jù)我的理解,需要根據(jù)每個(gè)項(xiàng)目的具體情況進(jìn)行分析。我的建議是,在工藝穩(wěn)定后,例如工藝路線已經(jīng)確定并且優(yōu)化工作已經(jīng)完成后,在小試生產(chǎn)階段同步開展評(píng)估。在這個(gè)階段,通常不會(huì)對(duì)之前的工藝進(jìn)行大幅調(diào)整,除非在后續(xù)放大過(guò)程中發(fā)現(xiàn)了一些問題,例如放大效應(yīng)導(dǎo)致雜質(zhì)超標(biāo)或者收率較大幅度的。一般情況下,建議在小試驗(yàn)階段進(jìn)行相應(yīng)的評(píng)估。這樣可以提前進(jìn)行方法開發(fā)和簡(jiǎn)單確認(rèn)工作,并且隨著逐步放大的過(guò)程,積累數(shù)據(jù),為后續(xù)的雜質(zhì)控制策略提供數(shù)據(jù)支持。
05 Case ultra 預(yù)測(cè)合規(guī)嗎?CDE老師認(rèn)可代替AMES實(shí)驗(yàn)嗎?
畢增:這個(gè)是合規(guī)的,可以放心。因?yàn)槲覀兺瓿傻亩鄠€(gè)仿制藥項(xiàng)目,包括新藥的IND申報(bào),還是客戶委托完成的發(fā)補(bǔ)的雜質(zhì)預(yù)測(cè),都有使用 Case ultra進(jìn)行預(yù)測(cè),都是沒有問題的。
Case ultra有Statistical Model(GT1_BMUT)統(tǒng)計(jì)學(xué)模型,該模型是通過(guò)RCA協(xié)議與美國(guó)FDA合作開發(fā)和驗(yàn)證的模型,訓(xùn)練集中包含13760個(gè)化合物;同時(shí)有Expert Rule Model(GT_EXPERT)專家規(guī)則模型,參考數(shù)據(jù)集中有17309個(gè)化合物作為參考數(shù)據(jù)集用于驗(yàn)證規(guī)則。警示結(jié)構(gòu)的數(shù)量有240個(gè),包含普通的陽(yáng)性警示結(jié)構(gòu),陽(yáng)性減弱和陽(yáng)性增強(qiáng)的子類型以及全局的陽(yáng)性減弱的警示結(jié)構(gòu)。
Case ultra可以滿足ICH M7同時(shí)使用兩種模型對(duì)化合物進(jìn)行預(yù)測(cè)的要求,并且所有的模型都是進(jìn)行過(guò)嚴(yán)格驗(yàn)證的,可以查看后臺(tái)數(shù)據(jù),可以查看警示結(jié)構(gòu)和相關(guān)細(xì)節(jié),擁有明確的算法和良好的預(yù)測(cè)透明度,符合OECD的相關(guān)規(guī)則。
06 三氟甲磺酸那個(gè)案例中樣品本身就有三氟甲磺酸,這個(gè)水解方式還能行嗎?
畢增:這個(gè)案例是由于在方法開發(fā)初期,我們對(duì)API進(jìn)行了三氟甲磺酸的檢測(cè),并未檢出該雜質(zhì)?;谶@個(gè)結(jié)果,我采用這種檢測(cè)方法,如果樣品中本身就有三氟甲磺酸檢出,則會(huì)導(dǎo)致雜質(zhì)被高估,這種情況下可以檢測(cè)水解后生成的另一個(gè)片段,比如說(shuō)在案例中的3-羥基-2-硝基吡啶。
07 雜質(zhì)的軟件評(píng)估都可以使用哪些軟件?
畢增:除了Case Ultra之外,Derek和Sarah也是同樣優(yōu)秀的商業(yè)預(yù)測(cè)軟件。當(dāng)然,除了商業(yè)軟件外,也有一些免費(fèi)的軟件,比如VEGA GUI,我個(gè)人使用過(guò)該軟件,預(yù)測(cè)的結(jié)果并不明確。可能是因?yàn)檐浖采w的的數(shù)據(jù)庫(kù)相對(duì)較小,覆蓋的化合物種類也有限,導(dǎo)致用于訓(xùn)練軟件算法的化合物數(shù)量較少,從而影響了計(jì)算結(jié)果的可靠性,合規(guī)性方面有較大的挑戰(zhàn),大家使用這類軟件的時(shí)候還是要慎重一些。
08 臨床上單次使用的局部給藥制劑中有一個(gè)雜質(zhì)超過(guò)了界定限度,要做哪些安全性評(píng)價(jià)?
畢增:對(duì)于制劑中超過(guò)界定限度的雜質(zhì),建議按照ICH Q3B(R2)的附件3-降解產(chǎn)物鑒定和界定決策樹進(jìn)行研究,首先要確定該雜質(zhì)是否能降低至小于等于界定限,如果不能的話則考慮根據(jù)患者人群、用藥時(shí)間進(jìn)行以下研究:致突變性研究(點(diǎn)突變、染色體畸變)、一般毒性研究(單個(gè)種類,通常14至90天)或者酌情考慮是否開展其他的毒性終點(diǎn)試驗(yàn)。
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