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藥物發(fā)現(xiàn)
Drug discovery
藥物發(fā)現(xiàn)

大環(huán)肽篩選(mRNA展示技術(shù))

mRNA展示技術(shù)是將基因型(mRNA)與表型(多肽/蛋白)融合的體外多肽/蛋白篩選技術(shù),將肽與其編碼mRNA進(jìn)行共價(jià)連接,使用嘌呤霉素作為連接物。美迪西應(yīng)用此技術(shù)構(gòu)建規(guī)模超過1013的mRNA展示庫,通過無細(xì)胞PURE體外翻譯系統(tǒng)將非天然氨基酸整合到多肽中,經(jīng)過對靶標(biāo)蛋白的親和純化后對與多肽連接的cDNA進(jìn)行測序,可精準(zhǔn)篩選到與靶標(biāo)相互作用的多肽。

mRNA展示庫的構(gòu)建
  • DNA庫制備:使用分子生物學(xué)技術(shù)制備DNA庫(通常為編碼約4~14個氨基酸的環(huán)肽) DNA庫的體外轉(zhuǎn)錄:通過RNA聚合酶的作用,DNA庫被轉(zhuǎn)錄成mRNA 嘌呤霉素連接:嘌呤霉素分子通過DNA連接子序列連接到每個mRNA上,嘌呤霉素是一種抗生素,作為氨基?;膖RNA類似物(tRNA在翻譯過程中向核糖體傳遞氨基酸),并作為mRNA和肽之間的連接子 mRNA庫的體外翻譯:mRNA-嘌呤霉素偶聯(lián)物進(jìn)行體外翻譯,由核糖體翻譯生成相應(yīng)的肽 線性肽的環(huán)化修飾:通過化學(xué)合成技術(shù)進(jìn)行環(huán)化修飾 逆轉(zhuǎn)錄:mRNA逆轉(zhuǎn)錄形成mRNA-cDNA雙鏈,產(chǎn)生mRNA/cDNA-嘌呤霉素-肽偶聯(lián)物庫
    整個過程均在體外進(jìn)行,無需依靠細(xì)胞。
體外篩選
  • 孵育與洗滌:將mRNA-cDNA-肽融合庫與固定在固體載體上的靶蛋白一起孵育,然后進(jìn)行洗滌以去除未結(jié)合的肽 擴(kuò)增、富集與測序:結(jié)合肽的cDNA通過PCR擴(kuò)增,然后用作DNA庫模板,在進(jìn)一步的重復(fù)幾輪mRNA展示庫篩選中,富集與靶蛋白高親和力的結(jié)合肽,最后通過cDNA的測序來確定多肽的結(jié)構(gòu)
    環(huán)肽篩選平臺.png

    Nat Rev Chem. 2020, 4(2): 90-101. doi: 10.1038/s41570-019-0159-2.Trends Pharmacol Sci. 2021, 42(5): 385-397. doi: 10.1016/j.tips.2021.02.004.

    除了多肽藥物體外篩選,美迪西還可以提供多肽藥物的合成服務(wù)。美迪西多肽合成研究團(tuán)隊(duì)長期致力于解決限制多肽藥物發(fā)展和應(yīng)用的核心問題,目前已建立了從上游非天然氨基酸結(jié)構(gòu)單元的合成、多肽藥物修飾和大規(guī)模合成,到下游多肽藥物信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和作用機(jī)制研究的完善體系。
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